Фамилия Олконен — редкий для России пример карельской или финской модели образования фамилий. Её основа — Олко- — восходит к уменьшительной форме православного имени Александр или, что вероятнее, к скандинавскому имени Olof (Олаф). В карельской и финской среде имя Александр нередко ужималось до Олексей или Олко, а суффикс -нен (в русской записи — -нен) указывает на принадлежность: «из рода Олко», «сын Олко».

В отличие от русских фамилий на -ов или -ин, модель с -нен типична для восточной Финляндии и приграничных районов Карелии, где в XIX веке активно шёл процесс закрепления наследственных фамилий у крестьян. До этого у карел и финнов было принято пользоваться отчествами или прозвищами, и фамилию Олконен могли дать первому в роду, кто отошёл от патронимической системы. Географически она тяготеет к бывшей Выборгской губернии, а также к территориям современной Ленинградской области и Карелии.

Версия о происхождении от прозвища, связанного с карельским «olkonen» (соломинка), маловероятна: такая основа не дала бы суффикса -нен в значении «сын», а скорее превратилась бы в прозвищную фамилию без окончания. Поэтому более надёжно считать Олконен патронимом, застывшим в финно-угорской форме.

В русских документах фамилия могла записываться с колебаниями: Олконен, Олконенн, реже Алконен. Двойное «н» в конце — следствие приспособления финского произношения к русской графике. Носители фамилии встречаются в основном среди потомков ингерманландских финнов и карел, переселявшихся вглубь России в XX веке.