Фамилия Оненов — одна из тех, что на первый взгляд кажется простой, но ставит перед исследователем несколько загадок. Главная из них — происхождение основы. Сразу отбросим версию о связи с калмыцким или монгольским именем Онен (река Онон) — хотя географические фамилии на -ов в принципе возможны, для русской ономастики это нетипично, и массового бытования фамилии в Забайкалье не зафиксировано.

Самая вероятная версия — диалектная. В северных и сибирских говорах словом «онен» или «оня» называли нечто маленькое, слабое, иногда — детёныша животного. В архангельских говорах, например, «оня» — ласковое обращение к ребёнку, почти как «малыш». Если так, то прозвище Онен мог получить либо самый младший в семье, либо человек невысокого роста. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Онена» или «из рода Онена».

Фамилия редкая, её география скудна. Основные следы — в центральных областях России (Тверская, Ярославская) и единичные записи на Урале. Это намекает на то, что фамилия могла возникнуть в среде крестьян или однодворцев, а не в дворянской среде, где предпочитали более «благозвучные» модели на -ский.

Менее вероятная, но допустимая версия — усечение от крестильного имени Онисим или Онисифор. В быту Онисима могли звать Оня, а от этой формы уже образовать Оненов. Но тогда ожидалась бы более распространённая фамилия — Онисимов или Онисифоров. Оненов — скорее прозвищная, чем патронимическая.

Словообразовательная модель проста: корень «онен» + суффикс -ов. Никаких редких суффиксов или чередований. Фамилия не меняла написания за последние три века: в ревизских сказках XVIII века она фигурирует именно как Оненов, без вариантов вроде Аненов.

Итог: скорее всего, предок носителя фамилии был прозван Онен за малый рост или за то, что был самым младшим в семье. Фамилия сохранила диалектное слово, которое сейчас почти исчезло из живого языка.