Фамилия Ониховская — женская форма фамилии Ониховский, образованная по стандартной для польских, украинских и западнорусских фамилий модели с суффиксом -овск-/-евск-. Такие фамилии обычно указывали на географическое происхождение: предок носителя был выходцем из населённого пункта с названием вроде Онихово, Онихов или Ониховичи. Подобных топонимов несколько на западе Украины и в Польше (например, село Онихов в Львовской области), поэтому фамилия имеет чёткую региональную привязку к бывшим землям Речи Посполитой.

Основа фамилии — имя Оних, которое является народной формой канонического имени Онисим (от греческого «полезный»). В украинской и белорусской традиции звук «с» часто выпадал или заменялся, поэтому Онисим превращался в Оних, а от него уже образовывались фамилии: Онихов, Ониховский и, соответственно, Ониховская. Таким образом, фамилия восходит к крестильному имени, а не к прозвищу или роду занятий.

Стоит отметить, что суффикс -ск- в этой фамилии — не русский, а польско-шляхетский по происхождению. Носители фамилии Ониховский (и Ониховская) в XVIII–XIX веках чаще всего относились к мелкопоместной шляхте или к однодворцам — потомкам служилых людей на южных рубежах России, которые сохраняли польские или западнорусские фамильные формы. В отличие от крестьянских фамилий на -ов/-ин, шляхетский суффикс -ский подчёркивал сословную принадлежность, пусть и не всегда высокую по имущественному положению.

Встречаемость фамилии сегодня невысокая, но стабильная: основная масса носителей живёт на западе Украины, в Беларуси и в центральных областях России (как результат миграций XIX века). Вариант написания с одной «н» (Ониховская) — единственно верный; путаница с двойной «н» (Онниховская) — ошибка, так как в основе фамилии нет удвоения.