Фамилия Опатский — довольно редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа, скорее всего, не связана с привычным церковным или профессиональным прозвищем, а указывает на географическое происхождение или принадлежность к определённому месту.

Наиболее правдоподобная версия — топонимическая. Фамилия могла образоваться от названия населённого пункта вроде Опаты, Опатово или Опатов. Такие названия встречаются в Польше, Чехии и на западе Украины (например, село Опатовцы). Суффикс -ский в русских, польских и украинских фамилиях классически указывает на связь с местностью: «из Опатова» или «опатовский». В этом случае предок носителя фамилии был либо выходцем из такого села, либо владел землёй в той местности (для дворянских фамилий).

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — от прозвища Опат. В древнерусском языке «опат» (или «абат») — это заимствование из латинского abbas, означающее «настоятель монастыря», «аббат». Слово было известно через польское посредничество. Однако в русской среде прозвище «Опат» давали не столько духовным лицам (для них были свои термины — игумен, архимандрит), сколько людям, чем-то напоминавшим аббата: возможно, важной осанкой, строгим нравом или просто любовью к порядку. От такого прозвища сначала возникла бы фамилия Опатов, а форма Опатский — уже вторичная, указывающая на потомка Опата.

Словообразовательно фамилия стоит в ряду таких же «географических» фамилий на -ский: Озерский, Горский, Полесский. Если же корень действительно связан с монашеским званием, то это редкий случай, когда в фамилии сохранилась форма, близкая к западноевропейскому, а не греческому варианту.

Точных исторических сведений о сословной принадлежности носителей фамилии Опатский нет, но суффикс -ский в XVIII–XIX веках часто закреплялся за дворянскими, шляхетскими или духовными фамилиями, хотя мог быть и искусственно присвоен при записи в семинарии. В любом случае, фамилия указывает на корни в западнорусских или польских землях.