Фамилия Ордуханов — одна из тех, где корень звучит непривычно для русского уха, и это сразу выдаёт её нерусское происхождение. Основа здесь — тюркское слово «орду» (в русской передаче «орда»), которое в древности означало не только «военный лагерь» или «ставку хана», но и «государство», «союз племён». Вторая часть — «хан» — титул верховного правителя у тюркских и монгольских народов. Таким образом, имя Ордухан (а фамилия образована от него с помощью русского патронимического суффикса -ов) буквально переводится как «хан орды» или «владыка войска».

Словообразовательная модель типична для фамилий народов Кавказа и Поволжья, которые в XIX–XX веках получали русские окончания. Суффикс -ов здесь указывает на принадлежность: Ордуханов — сын Ордухана. Само имя Ордухан — составное, характерное для тюркской антропонимии, где два значимых корня сливаются в одно имя-пожелание, подчёркивающее знатность или воинскую доблесть предка.

Географически фамилия Ордуханов чаще всего встречается среди народов Северного Кавказа, особенно у кумыков, ногайцев и чеченцев. Кумыкская среда — наиболее вероятная: в кумыкском языке слово «орду» сохранилось в значении «войско», а имена с компонентом «хан» были распространены у местной знати. Реже фамилию можно встретить у татар и башкир, где также бытовали подобные двусоставные имена.

В отличие от многих русских фамилий, которые ведут начало от крестильных имён или прозвищ по профессии, Ордуханов несёт в себе отчётливый социальный маркер. Человек, носивший имя Ордухан, скорее всего, принадлежал к военной или родовой аристократии — либо был сыном человека, который командовал отрядом или владел землями. Важно не путать эту фамилию с более известной Орлов: здесь нет связи с птицей, а есть прямая отсылка к тюркской государственной и военной традиции.

Встречаются варианты написания — Ордуханов и Ордуханян (последний — арменизированная форма, если носитель перешёл в армянскую среду), но основной корень остаётся тем же. В дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться через «а» — Ардуханов, что связано с особенностями произношения в некоторых диалектах.