Фамилия Орифхонов — яркий пример того, как в русскоязычном пространстве закрепилась фамилия восточного происхождения, образованная по тюркской модели. Её основа восходит к составному мужскому имени Орифхон, которое в свою очередь складывается из двух частей: «ориф» и «хон». «Ориф» (от арабского عارف — ‘ариф) означает «знающий», «сведущий», «мудрец», а в суфийском контексте — «познавший истину». Вторая часть — «хон» (от тюркского «хан») — традиционный титул правителя или повелителя, который в составе имени часто терял прямое значение и служил формой уважения, пожеланием величия.

Фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса -ов, который присоединяется к основе имени отца. Таким образом, Орифхонов буквально означает «потомок Орифхона», «сын Орифхона». Это типичная для XIX–XX веков практика: при интеграции народов Средней Азии в состав Российской империи их традиционные имена нередко русифицировали, добавляя фамильные окончания. Примечательно, что в исконной узбекской или таджикской среде такая фамилия не возникла бы — там сохраняется система отчеств без закреплённого суффикса, а фамилии часто оканчиваются на -зода, -и или вовсе отсутствуют.

Корень «Ориф» встречается и в других фамилиях, например, Орипов (с тем же значением, но без титула «хон»), что делает Орифхоновых более редкой ветвью. Носители фамилии, скорее всего, происходят из Узбекистана или Таджикистана, где имя Орифхон было распространено в среде духовенства или зажиточных семей, подчёркивая одновременно учёность и достоинство. Встречается также вариант написания через «а» — Арифхонов, что связано с особенностями произношения в разных диалектах персидского и тюркских языков. Фамилия не имеет отношения к русским дворянским родам, её история — это история советского паспортного учёта, который зафиксировал традиционное имя как наследственное родовое имя.