Фамилия Остаточникова — одна из тех, где основа говорит сама за себя, но с оговоркой: она не столько про «остаток», сколько про конкретное занятие. Слово «остаточник» в русских говорах XIX века означало не просто того, кто имеет дело с остатками, а мелкого торговца или скупщика остатков тканей, кож, металла — всего, что оставалось после основного производства. В текстильных губерниях (Ивановская, Владимирская, Костромская) остаточники скупали обрезки и лоскут у фабрик и перепродавали их на базарах. Прозвище Остаточник, таким образом, закреплялось за человеком с определённым ремеслом, а не за «последним» или «оставшимся».

Суффикс -ов- в мужской форме (Остаточников) указывает на принадлежность: «сын Остаточника». Женская форма Остаточникова — это либо жена, либо дочь такого человека. Модель образования типична для русских фамилий второй половины XVII–XIX веков, когда прозвища по роду занятий переходили в фамилии через патронимический суффикс.

Географически фамилия тяготеет к Центральной России, особенно к старым текстильным районам. В переписях и метрических книгах Владимирской и Костромской губерний XIX века встречаются крестьяне и мещане с этой фамилией, но нигде не было массового распространения — фамилия редкая, локальная. В отличие от более частых Ткачёвых или Кузнецовых, Остаточниковы не «размножились» по всей стране, потому что само ремесло остаточника было нишевым и не везде востребованным.

Существует и менее вероятная версия — от имени Остаток (уменьшительное от Евстафий или Остап), но она слабая: суффикс -ник- в основе («остаточник») не характерен для личных имён, а типичен именно для названий людей по занятию. Поэтому первая версия — основная.

В написании фамилии возможны варианты через «е» (Остатечников) в старых документах, но норма закрепилась с «о» и с «ч» после «т» — Остаточников/Остаточникова. Двойное «н» в суффиксе — результат присоединения -ник- к основе «остаток»: остаток → остаточник (с чередованием к/ч) → Остаточников.