Фамилия Паэглэ — один из тех случаев, когда написание почти не оставляет сомнений в происхождении. Это чистая эстонская фамилия, и её форма почти не пострадала при русификации, что само по себе редкость. В эстонском языке буква «ä» читается как нечто среднее между русскими «а» и «э», а конечное «э» — твёрдое и чёткое. Поэтому фамилия в оригинале звучит именно как Паэглэ, а не Паэгле или Паэгла.

Корень здесь — эстонское слово «päägla», которое означает «головная повязка» или «платок», который носили женщины, повязывая его особым образом. Скорее всего, прозвище Паэглэ получила женщина, которая либо носила такую повязку, либо, что вероятнее, изготавливала или продавала их. Суффикс «-э» в эстонских фамилиях часто выполняет ту же роль, что и русские «-ов» или «-ин»: он указывает на принадлежность, но в эстонском языке это скорее номинатив, чем патроним. То есть Паэглэ — это не «сын того, кто делает повязки», а просто «человек, связанный с повязкой» или «носитель повязки».

Эстонские фамилии в массе своей закреплялись поздно, в XIX веке, в ходе обязательной паспортизации. До этого у эстонцев часто были только имена и дополнительные прозвища по дому, ремеслу или внешности. Фамилия Паэглэ почти наверняка происходит из южной Эстонии, где диалектные формы слова «päägla» были особенно распространены. В северных диалектах чаще использовали «päe» или «pää», но именно с «gla» — это маркер тартуского или выруского говора.

В русском языке фамилия не склоняется, так как оканчивается на гласный, и это ещё один признак её нерусского происхождения. Встречается она крайне редко, в основном в Эстонии и среди потомков эстонских переселенцев в Сибири и на Дальнем Востоке. Никаких дворянских или купеческих корней у неё нет — это фамилия крестьянского или ремесленного сословия, что типично для эстонских фамилий, не имеющих немецкого окончания «-манн» или «-берг».