Основой фамилии Пахомычева послужило церковное имя Пахом. Мужское крестильное имя Пахом (Пахомий) в переводе с греческого означает «широкоплечий». Покровителем этого имени считается Святой мученик Пахомий, который за отказ принять магометанство был обезглавлен мусульманами в 1780 году. Скорее всего, основатель рода Пахомычевых был представителем высшего сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пахом, со временем получил фамилию Пахомычев.