Фамилия Памбукиди — яркий представитель греческих фамилий на -иди, которые массово появились в Российской империи после переселения греков из Османской империи в XVIII–XIX веках. Суффикс -иди (в русской передаче часто -иди, реже -идис) — это патронимический формант, буквально означающий «сын» или «потомок». В греческом языке ему соответствует окончание -ίδης, которое в новогреческом произношении звучит как -идис. Таким образом, Памбукиди — это «сын Памбука» или «из рода Памбука».

Основа фамилии — Памбук (греч. Pambuk или Bambuk). Слово это, скорее всего, тюркского происхождения: в турецком языке «pamuk» означает «хлопок». В греческом «βαμβάκι» (вамваки) — тоже «хлопок», но фамилия могла попасть в греческий через турецкое посредничество. Значение прозвища могло быть двояким. Первое — профессиональное: так могли прозвать торговца хлопком или человека, работавшего с хлопком. Второе — описательное: «белый как хлопок», то есть человек со светлыми волосами или очень бледной кожей. Для греков Малой Азии и Причерноморья, где были сильны турецкие влияния, такое прозвище не редкость.

В России фамилия Памбукиди закрепилась преимущественно в греческих диаспорах юга — в Крыму, Приазовье, Мариуполе, Одессе, а также в Грузии (в Абхазии и Батуми, где были греческие общины). Носители фамилии в большинстве своём были мещанами или купцами, реже — крестьянами. В советское время, в ходе паспортизации 1930-х годов, многие греки сменили окончания на русские (-ов) или русифицировали фамилии, но Памбукиди сохранила исходную форму. Сегодня она встречается нечасто, но её носители разбросаны по всей России, Украине и в греческой диаспоре Греции.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Памбукиди стоит в одном ряду с Памбуковым (русифицированный вариант), а также с греческими Памбакис (от того же корня, но с другим суффиксом) и Вавакиди (от греческого «вамваки»). Интересно, что в самой Греции фамилия Памбукиди почти не встречается — она характерна именно для понтийских греков, которые долго жили в тюркоязычной среде и заимствовали бытовую лексику.