Фамилия Панайдаки звучит для русского уха непривычно, и это не случайно: она — греческая по происхождению. Её основа восходит к греческому слову «панайя» (Παναγία) — «Пресвятая Богородица», «Всесвятая». Суффикс «-аки» — один из самых распространённых уменьшительных суффиксов в новогреческом языке, особенно характерный для фамилий Крита и других островов. Таким образом, Панайдаки — это не просто «принадлежащий к храму Панагии», а скорее «маленький Панайот» или «сын Панайота». Имя Панайот (Панайотис) — одно из самых популярных в Греции, образованное от того же корня и означающее «всесвятой».

Модель образования фамилии проста: личное имя (или прозвище, связанное с церковным праздником или иконой) + патронимический суффикс. В Греции фамилии на «-аки» массово закрепились в XIX веке, после освобождения от османского владычества, но сама модель гораздо старше. В русском контексте фамилия Панайдаки появилась, скорее всего, в XX веке — либо с волнами греческих эмигрантов из Турции и Причерноморья, либо как результат браков и переездов в советское время.

В отличие от русских фамилий, где суффикс указывает на отца (-ов, -ин) или местность (-ский), греческий «-аки» — маркер региона и одновременно уменьшительность. Носитель фамилии Панайдаки — почти наверняка потомок выходцев из Греции, возможно, из понтийских греков (жителей побережья Чёрного моря), у которых такие фамилии тоже встречаются. Социальный состав предков мог быть самым разным: от священников и торговцев до ремесленников, но церковное имя в основе указывает на глубокую связь семьи с православной традицией.

Стоит упомянуть, что в греческой среде фамилия может писаться и как Панайотаки, Панайяки — варианты зависят от местного диалекта и записи в документах. В русском языке закрепилась форма Панайдаки, где «й» перешло в «д» при адаптации (явление, известное как «йотация» в заимствованиях). Это делает фамилию не просто редкой, но и показательной для истории межъязыковых контактов.