Фамилия Пандухтян — армянская, и её разговор стоит начать не с корня, а с форманта: суффикс -ян (в старой орфографии -янц) указывает на принадлежность к роду или происхождение. Это самый распространённый патронимический суффикс в армянских фамилиях, аналог русских -ов/-ев. То есть Пандухтян буквально означает «из рода Пандухта» или «потомок Пандухта».

Основа — Пандухт — древнее армянское личное имя, которое состоит из двух частей: «пан» (заимствованное из иранского, означает «господин, владыка») и «духт» (дочь). В буквальном переводе Пандухт — «дочь господина» или «госпожа». Имя это было женским, что для фамилий не редкость: в Армении, как и во многих культурах, фамилию могли образовать от имени матери, если она была знатного рода или пользовалась особым уважением.

В историческом контексте имя Пандухт встречается в армянских источниках, например, в средневековых генеалогиях знатных родов. Носительница такого имени могла быть княжной или женой влиятельного человека. Со временем имя превратилось в родовое прозвище, а затем — в фамилию, закрепившуюся за потомками.

География фамилии Пандухтян традиционно связана с историческими армянскими областями — Западной Арменией (в частности, районом Вана) и Восточной Арменией (Ереван, Арташат). После геноцида армян 1915 года многие носители фамилии оказались в диаспоре — в России, Франции, США, Ливане. В современной Армении фамилия встречается, но не входит в число самых частотных.

Интересная деталь: в отличие от многих армянских фамилий на -ян, которые образованы от распространённых имён (Петросян, Арутюнян), Пандухтян сохраняет редкое и поэтичное имя-основу. Оно не имеет ничего общего с «пандусом» или другими случайными созвучиями — корень чисто иранский, через посредство армянского языка. Фамилия не переводится как «сделанный из пандуса» или что-то подобное, это просто память о знатной предке.