Фамилия Пандин — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, не связано с профессией или характером, а образовано от слова с бытовым значением. В основе лежит древнерусское «панда» — так в некоторых говорах называли панду или ковш, то есть сосуд для питья, черпак. Человек мог получить прозвище Панда за привычку пить из большой посуды, за профессию изготовителя ковшей или просто в насмешку над любителем хмельного. Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?») — Пандин значит «сын Панды» или «человек из рода Панды».

Версия с греческим именем Пандион (мифический афинский царь) или Пандим (эпитет Афродиты) маловероятна для русской фамилии — такие имена не бытовали в крестьянской среде, а в духовенстве их не фиксируют справочники. Гораздо правдоподобнее связь с диалектным глаголом «пандить» — «гнуть, клонить, нагибать». В этом случае Панда — прозвище сутулого или сгорбленного человека. Оба значения — «ковш» и «согнутый» — сходятся в образе: изогнутый предмет или человек с изогнутой спиной.

Фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье, что косвенно подтверждает её происхождение из народных говоров. В дворянских родословных книгах Пандины не значатся — это фамилия крестьянская или мещанская. Ударение в ней плавает: в одних семьях говорят Пáндин, в других Пандúн, что характерно для фамилий, образованных от коротких прозвищ.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Панда, Пандов, Пандинский — показывает, что суффикс -ин самый частый для этой основы. Если ваш предок носил фамилию Пандин, он с большой вероятностью жил в среде, где слово «панда» было в ходу, и его прозвали либо по утвари, либо по внешности. Других версий, подкреплённых источниками, у ономастики нет.