Фамилия Пандюкова — женская форма от Пандюков, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффикса, который сразу выдаёт географию. Суффикс -ов (-ев) указывает на центральные и северные регионы России, где такие фамилии образовывались от прозвищ или имён отца. Но в случае с Пандюковым мы имеем дело с довольно редкой основой, которая встречается в основном на юге России и в Поволжье.

Основа «Пандюк» почти наверняка восходит к прозвищу, а не к крестильному имени. Самая вероятная версия — связь с диалектным словом «панда» или «пандюха». В южнорусских говорах так называли неуклюжего, медлительного человека, иногда — увальня или лентяя. Суффикс -юк в прозвище (Пандюк) типичен для украинского и южнорусского словообразования: он придаёт оттенок принадлежности или характерности (ср. «козак» — «козачук», «малый» — «малюк»). То есть Пандюк — это буквально «сын или человек, похожий на Панду», где Панда — исходное прозвище.

Менее убедительна, но возможна связь с тюркскими корнями. В ряде тюркских языков «панды» (или «банды») означает «клятва», «обет», но для фамилии Пандюков такое значение маловероятно — скорее всего, это случайное созвучие. Также не стоит путать с фамилией Пандиков, которая могла образоваться от греческого имени Пантелеймон (через форму Пандик). Пандюков — иная модель, с характерным южнорусским суффиксом, что подтверждает его прозвищное происхождение.

Кем были предки? Скорее всего, крестьяне или однодворцы из южных губерний — Курской, Воронежской, Тамбовской. Прозвище «Пандюк» не несло оскорбительного оттенка, а просто описывало манеру поведения или внешность: медлительный, основательный человек. В XIX веке фамилия фиксируется в метрических книгах Воронежской губернии, что подтверждает её региональную привязку. Дворянских родов с такой фамилией не известно, а значит, перед нами типичная крестьянская фамилия, образованная от бытового прозвища, которое со временем закрепилось за родом.