Фамилия Панадин — редкий случай, когда прозвище «выросло» из церковного обряда, а не из имени, ремесла или внешности. Основа здесь — слово «панагия» (от греческого panagia — «всесвятая»). Так называют небольшую икону Богородицы, которую носят на груди архиереи, а также просфору в честь Божией Матери. Человек мог получить прозвище Панада за то, что носил такую икону (например, монах или церковный служитель), либо за усердие в молитве.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Панады». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от прозвищ и имён, оканчивающихся на -а/-я. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в северных и центральных регионах, -ин распространён повсеместно, но особенно характерен для Рязанщины, юга России и Поволжья. Однако география фамилии Панадин узкая: основные носители сосредоточены в Воронежской области и на востоке Украины, что может говорить о локальном происхождении прозвища.

Интересно, что в русском языке есть и другие фамилии от того же корня: Панагин, Панаев. Но Панадин стоит особняком — возможно, это результат диалектного произношения (утрата «г» или замена на «д»). В некоторых говорах «панагия» звучала как «панадья», отсюда и прозвище «Панада». Вторая, менее вероятная версия — связь с греческой фамилией Панадис (от panadis — «всеведущий»), но она не объясняет суффикс -ин, типичный именно для русской ономастики.

Сословная принадлежность предков неясна. Скорее всего, это были крестьяне или однодворцы — в документах XIX века фамилия встречается среди государственных крестьян Воронежской губернии. Никаких известных дворянских родов с такой фамилией нет. Сегодня Панадин — одна из тех фамилий, что сохранилась в памяти немногих семей, а её корни уходят в церковную лексику, а не в бытовые прозвища.