Фамилия Паненский — одна из тех, где сразу бросается в глаза суффикс -ский. В русской ономастике это типичный признак фамилий, образованных от географических названий: сел, деревень, урочищ. Чаще всего такую фамилию получали дворяне (по названию своего поместья) или духовенство (по месту службы). Однако корень «Панен-» неочевиден и заставляет задуматься.

Самая вероятная версия — происхождение от названия населенного пункта вроде Паненки или Паненское. Такие топонимы действительно встречаются, особенно в западных и южных регионах бывшей Российской империи. Например, в Польше есть деревня Panienki, а на Украине — село Паненки. В основе этих названий лежит слово «паненка» — уменьшительное от «панна» (барышня, незамужняя женщина). То есть Паненский мог означать «выходец из села, где жили паненки» или «принадлежащий к усадьбе, связанной с паннами».

Вторая, менее распространенная версия, связывает фамилию с прозвищем. В некоторых говорах «паненок» могли называть избалованного, капризного парня, который вел себя как барчук. Но здесь важно: прозвище «Паненок» дало бы фамилию Паненков, а не Паненский. Поэтому географическая версия выглядит убедительнее, тем более что суффикс -ский в русских фамилиях редко цепляется напрямую к прозвищам — он тяготеет к местам.

Стоит также учесть, что фамилия Паненский могла быть семинарской. В духовных училищах будущим священникам нередко меняли «неблагозвучные» бытовые фамилии на более книжные, образованные от названий храмов или сел. Если в селе Паненки стояла церковь, то ее служитель мог получить фамилию по храму. В любом случае, носитель фамилии Паненский, скорее всего, имел предка, который либо владел землей в деревне с «панским» оттенком, либо служил в ней при церкви.