Фамилия Паннизовский — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не ремесло и не черта характера, а топоним, который почти невозможно найти на современной карте. Она образована по типичной для польской и западнорусской шляхты модели: корень паннизов- плюс суффикс -ский. В буквальном смысле Паннизовский — это «тот, кто родом из Паннизова».

Главная загадка — что такое Паннизово? Скорее всего, это название села или усадьбы. В польском языке есть слово «niz» (низ), а приставка «pan-» может указывать на владельца (панский низ). Однако правдоподобнее версия, что Паннизово — это искажённое Поднизовье или Панизовье. В белорусских и украинских говорах «панізоўе» означает низменную местность, пойму реки. Если так, то предок носителя фамилии жил в низине, а со временем название места переосмыслили как «Паннизово» — возможно, из-за того, что земля принадлежала пану.

Суффикс -ский в этой фамилии — не случайность. Он указывает на дворянское или шляхетское происхождение. В Речи Посполитой фамилии на -ский носили в основном землевладельцы, даже если владение было крошечным. Паннизовские, скорее всего, были мелкопоместной шляхтой, чей родовой гнёздышко затерялось где-то на границе современной Беларуси и Польши. После разделов Речи Посполитой такие фамилии перешли в русскую среду, часто с изменением ударения — в оригинале оно падало на предпоследний слог (Паннизо́вский), но в русском языке могло сместиться.

Однокоренных фамилий практически нет. Встречаются Низовский, Панизовский — но Паннизовский с двойным «н» стоит особняком. Двойное «н» могло возникнуть из-за описки в метрических книгах или как следствие народной этимологии: писарь «усилил» корень, чтобы подчеркнуть связь с паном. Найти носителей фамилии сегодня можно в основном в западных областях России и в Беларуси, но она остаётся очень редкой.