Фамилия Пановиков — редкий случай, когда суффикс и основа вступают в противоречие, заставляя выбирать между двумя разными историями происхождения. В ней слышится и фамилия Панов, и фамилия Панович, но добавленное -ов меняет всё.

Самый прямой путь — отыменная модель. В основе лежит имя или прозвище Пан, Паня. На Руси так могли называть человека, которого в шутку величали «паном» — барином, господином, хозяином. Иногда это было ироничное прозвище для того, кто держался важно, но не имел на то оснований. От прозвища Пан образовали фамилию Панов — через стандартный суффикс -ов. А Пановиков — это уже вторичная форма: от фамилии Пановых отсекли окончание, добавили -ик (уменьшительный или патронимический суффикс) и снова прилепили -ов. Получилась «фамилия от фамилии»: Пановиков — сын того, кто был Пановиком, то есть потомком Пановых. Такая цепочка встречается редко и указывает на то, что носители хотели подчеркнуть принадлежность к определённому роду.

Вторая версия — географическая. Фамилия могла закрепиться за выходцем из деревни с названием Пановики или Паново. В русской ономастике суффикс -ик часто указывает на жителя определённой местности: «пановик» — человек из Панов. Тогда Пановиков — это буквально «сын пановика», то есть переселенца из Панов. Такая модель типична для северных и сибирских регионов, где фамилии нередко фиксировали место выхода семьи.

Интересно, что фамилия почти не встречается в центральных губерниях. Основной ареал — Вологда, Архангельская область, а также Урал и Сибирь, куда фамилию могли принести переселенцы. Написание с -иков вместо более привычного -ов говорит о том, что фамилия формировалась не в канцеляриях, а в живой речи, где двойной суффикс не резал слух.

Социальный статус предков, скорее всего, был крестьянским или мещанским. Дворянских родов с такой фамилией в родословных книгах не зафиксировано. Это «народная» фамилия, которая прошла через несколько ступеней словообразования, но сохранила прозрачную связь с прозвищем или названием места.