Фамилия Панцакова — женская форма фамилии Панцаков, и её происхождение лучше всего рассматривать через мужской вариант. Перед нами типичная русская фамилия на -ов, образованная от прозвища или имени Панцак. Сама основа Панцак- звучит необычно и встречается нечасто, что сразу указывает на её нестандартное происхождение.

Скорее всего, в основе лежит слово «панец» или «панич» — в южнорусских и украинских говорах так называли молодого барина, паныча, а иногда и просто изнеженного, щеголеватого человека. Суффикс -ак в прозвищах часто придавал оттенок принадлежности или характерного признака: Панцак — то есть «тот, кто из панов», «похожий на пана», «паныч». Такая модель словообразования (основа + -ак + -ов) типична для фамилий, возникших в среде казачества и крестьянства западных и южных регионов России. Фамилия могла закрепиться за человеком, который одевался по-барски или держался с достоинством, не соответствующим его сословию.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным глаголом «панцовать» (в некоторых говорах — «чистить», «прихорашиваться»). Тогда Панцаком могли прозвать чистюлю или щёголя. Ещё один вариант — искажённое «Пантелеев» или «Панкратов»: в устной речи фамилии на -ов нередко переделывали на более удобный лад, отбрасывая часть корня и добавляя -ак. Однако в этом случае исходная форма должна была быть Пантелеяк или Панкратяк, что маловероятно.

Географически фамилия Панцаков тяготеет к Ростовской области и Краснодарскому краю, что косвенно подтверждает её южнорусские корни. Встречаемость фамилии невысокая — она редкая, не попала в массовые списки дворянских или купеческих родов. Её носители почти наверняка происходят из крестьянской или казачьей среды, где прозвища такого типа были обычным делом. Примечательно, что в фамилии сохранился твёрдый звук [ц] на месте более привычного [ч] (сравните с «Панчуков»), что указывает на диалектные особенности произношения у предков.