Основой фамилии Паняев послужило имя Паня. Паня — производная форма крестильных мужских имен Пантелеймон (в переводе с греческого - «всемилостивый), Панкратий (от древнегреческого pankratos – «сильнее всех»), Панфил (в переводе с греческого - «всеми любимый»).