Фамилия Панюсько звучит на украинский лад — и это первый ключ к разгадке. Суффикс -к-о (с ударением на последний слог или на основу) типичен для западноукраинских и подольских фамилий, образованных от личных имён или прозвищ. В русском языке такой модели почти нет, зато в украинской ономастике она одна из самых распространённых: Шевченко, Коваленко, Бондаренко — и Панюсько стоит в том же ряду, только с менее частотной основой.

Основа Панюсь — это, скорее всего, уменьшительно-ласкательная форма от имени Пантелеймон или Панкрат. В украинской народной традиции имя Пантелеймон сокращали до Панько, Панюта, Панюсь. Вторая буква «ю» здесь — результат смягчения и перехода звука: Пантелей → Пантель → Пантьо → Панюсь. Фамилия буквально означает «сын или потомок Панюся», то есть человека, которого в быту звали ласково Панюсь.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с польским словом pan (пан, господин). В этом случае Панюсько могло бы означать «маленький пан» или «сын пана», но фонетика здесь подводит: для такой модели ожидалось бы что-то вроде Панько или Панасюк, а не Панюсько. Кроме того, суффикс -усь встречается именно в украинских уменьшительных формах имён (Михась, Івась, Панюсь), а не в прозвищах по социальному статусу.

Географически фамилия Панюсько чаще всего встречается в западных областях Украины — на Тернопольщине, Хмельниччине, в меньшей степени на Волыни. В России она редка и, как правило, принадлежит потомкам переселенцев с Украины конца XIX — начала XX века.

Сословного барьера у этой фамилии нет: её могли носить как казаки, так и крестьяне или мещане. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок носителя фамилии Панюсько был человеком, которого в кругу семьи или односельчан называли уменьшительным именем Панюсь, а его дети и внуки закрепили это прозвище как родовое имя.