Фамилия Папегут — один из тех редких случаев, когда носитель русского языка, взглянув на написание, сразу чувствует: корни здесь не славянские. И действительно, это фамилия немецкого происхождения, причём довольно прозрачная по составу. Она образована от двух немецких основ: «Pape» (папа, отец, а в средневековом контексте часто — священник, поп) и «Gut» (добро, имущество, хозяйство). Буквально фамилию можно перевести как «попово добро» или «поповское хозяйство».

Скорее всего, Папегут — это прозвище, данное человеку, который жил на земле, принадлежащей церкви или конкретному приходу, либо работал в церковном хозяйстве. В Германии такие прозвища были распространены среди крестьян, арендовавших наделы у местного пастора. Другая, менее вероятная версия — что так могли назвать сына священника (как указание на его происхождение), но слово «Gut» всё же указывает скорее на имущественные, а не родственные отношения.

Написание фамилии — слитное, что типично для немецких фамилий, образованных от двух слов. Окончание не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), поэтому фамилия в русском языке не склоняется, если принадлежит мужчине (Иван Папегут), и склоняется, если принадлежит женщине (Анны Папегут). Встречается она в основном в областях России, куда в XVIII–XIX веках приглашали немецких колонистов (Поволжье, юг Украины, а позже — Сибирь). Из-за редкости фамилии её носители, скорее всего, являются потомками одной или нескольких семей переселенцев, сохранивших исходную форму без изменений.

В русском языке фамилия звучит необычно, что часто вызывает вопросы об ударении. Логичнее всего ставить ударение на второй слог: Папе́гут, как в немецком «Papegut». Однако в бытовой речи потомки переселенцев могли переносить ударение на последний слог, подстраиваясь под русскую интонацию.