Фамилия Паргункина — редкий случай, когда женская форма может рассказать о происхождении больше, чем мужская. Мужской вариант — Паргункин. Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Паргунка. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — «сын Паргунки». Такая модель типична для фамилий, образованных от слов на -а, -я.

Корень — Паргун — почти наверняка восходит к диалектному или устаревшему слову. В русских говорах, особенно северных и вологодских, «паргун» или «паргуня» могло означать ворчуна, брюзгу, человека, который говорит невнятно или сердито. Сравните с глаголом «паргать» — шуметь, ворчать, а также с однокоренными «парга» (ссора, брань) и «паргусить» (шептать, ворчать). Таким образом, Паргункой в XVI–XVII веках могли прозвать неугомонного, сварливого или просто неразборчиво говорящего человека. Версия о связи с тюркскими корнями (например, «паргын» — часть, отрезок) маловероятна для фамилии с типично русским суффиксом -ин и ареалом бытования в центральной России.

География фамилии Паргункиных узкая. По данным современных телефонных справочников и архивных упоминаний, основное гнездо фамилии — Тверская область и прилегающие районы Новгородчины. Это косвенно подтверждает севернорусское происхождение корня: именно в новгородских и тверских говорах слово «паргунить» (ворчать) фиксируется лексикографами.

Социальный контекст тоже проясняет картину. Фамилии на -ин в крестьянской среде были массовыми, но Паргункины — не дворянский род. Скорее всего, предки носителя фамилии были государственными или помещичьими крестьянами, возможно, занимались отхожими промыслами. В метрических книгах XIX века фамилия встречается в записях о крестьянах деревень Вышневолоцкого и Осташковского уездов.

Итог простой: фамилия Паргункина образована от прозвища Паргунка («ворчун», «брюзга») с помощью патронимического суффикса -ин. Ареал бытования — Тверская и Новгородская губернии, что указывает на крестьянское происхождение и связь с северными русскими говорами.