Фамилия Патуткова — редкий случай, где на первый план выходит не корень, а суффикс. Её основа — Патутко, а окончание -а указывает на женскую форму. Сама фамилия Патутко, скорее всего, белорусского или украинского происхождения. Суффикс -ко в восточнославянских фамилиях — один из самых распространённых уменьшительно-ласкательных, он же мог указывать на сына по отцу. То есть Патутко — это «маленький Патута» или «сын Патуты».

Корень здесь — Патута. Это древнее славянское прозвище, которое восходит к глаголу «патать» (в диалектах — бить, колотить, а также пачкать, марать). В словаре Владимира Даля находим слово «патута» — «неуклюжий, неловкий человек, разиня». Скорее всего, прозвище Патута давали человеку медлительному, нерасторопному или, наоборот, тому, кто часто пачкался в работе. Вторая версия, менее вероятная, связывает корень с «патока» — сладкая масса, но для прозвища это слишком узкое значение.

Географически фамилия Патутко тяготеет к западным областям России, а также к Беларуси и Украине. Встречается она нечасто, в основном в Смоленской, Брянской и Псковской областях, где сильны белорусские диалектные влияния. Модель образования типична для крестьянских фамилий: прозвище отца (Патута) превратилось в фамилию сына (Патутко), а затем, при замужестве, дочери или вдовы — в Патуткова. В документах XVIII–XIX веков такие фамилии могли фиксироваться как Патутковы, но форма с -о в основе устойчивее.

Если сравнивать с однокоренными, то ближайшие родственники — фамилии Патутин, Патутов, Патуткин. Все они от одного прозвища, но различаются суффиксами, которые показывают разную региональную традицию оформления. Патуткова — вариант, сохранивший белорусскую огласовку, что делает её особенно ценной для локальной истории.