Фамилия Пайнева звучит необычно для русского уха, и это не случайно. В её основе лежит прозвище Пайна, которое, по самой убедительной версии, связано с поморским рыбным промыслом. В архангельских говорах «паина» — это толстая палка или шест, которым рыбаки удерживают сеть подо льдом во время подлёдного лова. Прозвище Пайна могли дать опытному рыбаку, мастеру своего дела, или же человеку, который изготавливал такие снасти. Эта версия выглядит правдоподобнее остальных, поскольку объясняет фамилию через конкретное занятие предков и имеет чёткую географическую привязку к Русскому Северу.

Существуют и другие гипотезы, но они менее убедительны. Одна из них возводит основу к польскому слову pajęczy, то есть «паучий». Вряд ли такое прозвище закрепилось бы за русским крестьянином или рыбаком, скорее это след случайного созвучия. Также Пайну могли связывать с глаголом «паять», но и здесь связь туманна: прозвища от этого глагола обычно указывали на ремесло паяльщика, но форма «Пайна» для него нехарактерна.

Сама фамилия образована по стандартной для русских фамилий модели: к основе Пайн- добавили суффикс -ев-, который указывает на принадлежность роду. То есть Пайнева — это «дочь или жена Пайны», а изначально фамилия звучала как Пайнев и лишь позже, в женском роде, закрепилась форма Пайнева. Такое окончание типично для фамилий, образованных от слов с мягкой или шипящей основой.

Интересно, что фамилия Пайнева встречается редко и не имеет массового распространения, что косвенно подтверждает её северное, диалектное происхождение. В центральных и южных губерниях России такое прозвище вряд ли возникло бы, поскольку там не знали ни «паины», ни самого способа ловли рыбы из-подо льда. Таким образом, предки носителей фамилии, скорее всего, жили на побережье Белого моря или в бассейне Северной Двины, где рыболовство было основой выживания.

Стоит отметить, что фамилия закрепилась именно в женской форме, что для современных носителей может быть связано с тем, что в семье передавалась фамилия матери. Однако исторически это просто грамматическая форма, и мужской вариант Пайнев существовал наравне с ней. Следы фамилии можно найти в метрических книгах архангельских приходов, но систематического изучения этой фамилии в научной литературе нет, поэтому любые выводы о конкретных носителях остаются лишь предположениями.