Прозвище Пайна происходит, вероятно, от диалектного слова «паина»: в архангельских говорах так называли толстую палку, которой удерживают сеть подо льдом. Соответственно, Пайной могли называть рыбака. Согласно другой версии, в основе этой фамилии лежит польское слово pajeczy – «паучий». Наконец, нельзя исключить, что прозвище Пайна связано с глаголом «паять». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пайна, со временем получил фамилию Пайнева.