Фамилия Пекилис — редкий случай, когда за русским суффиксом скрывается нерусская основа. Скорее всего, перед нами литовская или латышская фамилия, адаптированная под славянскую модель. Разберёмся по порядку.

Ключ к разгадке — окончание -ис. В литовском и латышском языках это стандартный показатель мужского рода в именительном падеже (как -as у литовцев или -s у латышей). В русской среде такие фамилии часто «обрусевали», но могли и сохранять исходный вид, если носитель или переписчик не менял окончание. Так что Пекилис — это не исконно русская фамилия, а балтийская по происхождению.

Основа фамилии — Pekil-. Здесь возможны два пути. Первый: литовское pekėti — «печь, жечь, припекать» (от pekti). В таком случае прозвище Пекилис мог получить человек, связанный с выпечкой, печным делом, либо обладающий горячим, «жгучим» нравом. Второй вариант: связь с литовским peklė — «ад, преисподняя» (слово того же корня, что и русское «пекло»). Тогда прозвище носило мрачноватый, но не обязательно оскорбительный оттенок — так могли назвать сурового, угрюмого человека или того, кто жил в особенно жарком месте.

Суффикс -ил- (-il-) в балтийских фамилиях встречается, но не так часто, как в славянских. Он мог быть уменьшительным или указывать на носителя признака. В русском языке похожая модель дала бы фамилию Пекилов (от прозвища Пекило). Но здесь сохранился балтийский след.

География фамилии — северо-запад бывшей Российской империи: Литва, Латвия, а также смежные районы Беларуси и Псковской области, где веками жили балтские народы. Встречаемость фамилии крайне низкая, что подтверждает её локальный, а не массовый характер.

Таким образом, Пекилис — это балтийская фамилия, образованная от прозвища, связанного с огнём, жаром или печью. Носитель фамилии мог быть пекарем, истопником или просто человеком с крутым нравом. Фамилия не получила широкого распространения за пределами своего региона и сохранила оригинальное литовское окончание.