Фамилия Пелыпенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала массово заменять старые отчества и прозвища в казацкой среде и среди крестьянства Левобережной Украины. Суффикс -енко изначально означал «маленький» или «сын такого-то», то есть Пелыпенко — это буквально «сын Пелыпа».

Основа фамилии — имя Пелып, которое является просторечной, народной формой канонического имени Филипп. В украинском языке начальное «Ф» в заимствованных словах часто переходило в «П» (сравните: Филипп → Пилип, Федор → Педор, хотя последнее встречается реже). Таким образом, Пелыпенко — это украинская версия русской фамилии Филиппенко или Филиппов. Имя Филипп (от греческого «любящий коней») было распространено в православных святцах, поэтому неудивительно, что оно дало множество производных фамилий.

С географической точки зрения фамилия Пелыпенко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Полтавщине, Черкащине, Сумщине. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках эта фамилия встречается в сёлах, где, судя по контексту, носители были либо казаками, либо государственными крестьянами. Дворянской эта фамилия не была — суффикс -енко в малороссийской традиции почти не использовался для формирования фамилий шляхты, которая предпочитала окончания -ский/-цкий.

В русском языке фамилия сохранила украинское написание и произношение через «ы», что нередко приводило к путанице при записи в паспорта и документы: можно встретить варианты Пелепенко (с «е» во втором слоге) или Пилипенко (с «и»). Однако именно форма Пелыпенко — более архаичная, отражающая диалектное произношение, где звук «и» в безударной позиции мог редуцироваться до «ы» или «е». Если ваш предок носил эту фамилию, скорее всего, он происходил из семьи, где имя Пилип (Филипп) передавалось из поколения в поколение, и фамилия закрепилась как отчество третьего поколения.