Фамилия Пердоно — редкий случай, когда основа прозвища лежит на поверхности, но её происхождение неоднозначно. В русском языке сразу вспоминается глагол «пердеть», и логично предположить, что прозвище Пердоня (или Пердона) дали человеку с характерной физиологической особенностью — например, страдающему метеоризмом. Однако есть и другая версия, более древняя и менее очевидная.

В древнерусском языке слово «пердеть» имело не только современное значение, но и могло означать «громко выпускать воздух» в переносном смысле — то есть «пустословить», «хвастаться», «говорить вздор». В этом ключе прозвище Пердона или Пердо могло закрепиться за болтуном или пустым хвастуном. Такие прозвища по поведению (Говорун, Балабол, Шум) были обычны в крестьянской среде и не несли в себе грубой брани, а скорее описывали характер.

Форма фамилии — на -о, что нетипично для русских фамилий с суффиксом -ов/-ев. Окончание «-о» (Пердоно) указывает на украинское или западнорусское происхождение. В украинском языке фамилии на -о (Ткаченко, Коваленко) образуются от патронимов, но здесь основа не имя, а прозвище. Скорее всего, исходная форма — Пердоня, а фамилия Пердоно — это русифицированный или украинизированный вариант, где окончание «-я» заменилось на «-о» под влиянием местных говоров. Встречается также фамилия Пердонов, что подтверждает единый корень.

Географически фамилия крайне редкая. По базам данных переписей XIX — начала XX века, единичные носители фиксируются в южнорусских и украинских губерниях (Полтавская, Харьковская, Курская). В центральной России она почти не встречается. Это говорит о том, что фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, возможно, от одного прозвища, данного конкретному человеку.

Версия о связи с итальянским «perdono» (прощение) или французским «perdono» — маловероятна. Фамилия не имеет следов дворянского или иностранного происхождения, а её фонетика и морфология типичны для восточнославянских прозвищ. Если бы предок был итальянцем или французом, фамилия сохранила бы ударение и написание, близкое к оригиналу, а не адаптировалась под русскую модель с суффиксацией.

Таким образом, носитель фамилии Пердоно может с большой вероятностью считать, что его предок получил прозвище либо за физиологическую особенность (что в крестьянском быту не считалось оскорблением), либо за склонность к пустой болтовне. Фамилия — редкая, южнорусская или украинская, и её значение не выходит за рамки бытовых прозвищ, распространённых в XVIII–XIX веках.