Фамилия Перекора — один из тех случаев, когда прозвище перешло в наследство напрямую, почти без изменений, и суффикс здесь не главное. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов/-ев или -ин, Перекора не образовывалась по схеме «чей сын?». Она застыла в форме исходного прозвища, и это сразу указывает на её возможное происхождение: скорее всего, перед нами прозвище из среды, где фамилии начали закрепляться позже или где сохранялась архаичная модель — например, на Украине, в Белоруссии или в южнорусских землях.

Основа фамилии — глагол «перекоряться», то есть спорить, перечить, упрямиться. В словаре В. И. Даля «перекора» — это взаимный укор, попрёк, перебранка. Прозвище Перекора могли дать человеку сварливому, любящему вставлять своё слово поперёк чужого. В этом смысле фамилия — близкая родственница таким фамилиям, как Перекоренко, Перекорин, и более известной Перекатов. Но есть и второй, менее очевидный вариант: в некоторых говорах «перекор» означал не ссору, а препятствие, помеху. Тогда прозвище могло закрепиться за человеком, который постоянно оказывался «наперекор судьбе» — неудачником или, наоборот, упрямцем, преодолевающим преграды.

География фамилии подтверждает её южнорусские и украинские корни. Перекора встречается в Черниговской, Полтавской, Харьковской губерниях, а также на Кубани — там, куда переселялись казаки из Малороссии. В центральных великорусских областях фамилия редка. Если ваши предки — выходцы с этих земель, то прозвище могло быть дано предку-казаку или крестьянину, известному своим крутым нравом.

Что касается сословной принадлежности, то фамилии в форме чистого прозвища без суффикса чаще встречались у казачества и среди крестьян, особенно в тех регионах, где фамилии долго не были обязательными. Дворянские роды обычно оформляли фамилию через -ский или -ов, так что Перекора — скорее всего, фамилия из народной среды. В написании она стабильна: ударение падает на последний слог (Переко́ра), и двойное «р» в корне — не ошибка, а отражение приставки «пере-» и корня «кор» (от «корить»). Так что фамилия эта — живое напоминание о том, что когда-то вашего предка называли не по отцу, а по характеру.