Фамилия Перналиева — редкий случай, когда географическое происхождение почти наверняка перевешивает любые другие версии. Основа «Пернал-» явно отсылает к топониму Перналь, Пернали — так называется село в Гардабанском муниципалитете Грузии, в исторической области Квемо-Картли (Нижняя Картли). Фамилия, скорее всего, образована от названия этого села: Пернали + суффикс -ев/-ова, который в русской традиции добавили при оформлении фамилии для женщин. То есть перед нами типичная «географическая» фамилия, указывающая на выходцев из конкретного места.

Суффикс -ев (в женском варианте -ева) — самый распространённый в русском языке, но здесь он наложился на нерусскую основу. Это говорит о том, что носители фамилии долгое время жили в русскоязычной среде или фамилию фиксировали по русским документам. В самой Грузии фамилия звучала бы иначе: например, Перналишвили или Перналидзе. Форма Перналиева — результат адаптации, что типично для народов Закавказья, чьи фамилии «обрусели» в XIX–XX веках.

Мужской вариант — Перналиев. Если разобрать его по составу, то корень «Пернал», суффикс «-ев». Никакого тюркского или арабского следа в основе нет, хотя по звучанию фамилию можно спутать с мусульманскими. Это не так: Перналь — грузинский топоним, а сама фамилия встречается преимущественно у народов, исторически связанных с Грузией и югом России.

Единственная альтернативная версия — связь с личным именем или прозвищем, но она слабая. В ономастике нет известного имени Пернал, а попытки вывести основу из тюркского «бир» (один) или «перна» (крыло) выглядят натяжкой. Гораздо логичнее опереться на географию: село Пернали существует, и фамилия Перналиев/Перналиева — это указание на «того, кто родом из Пернали». Такие фамилии часто давали переселенцам: человек уезжал из родного села, и его идентифицировали по месту выхода.

Социально предки могли быть крестьянами, ремесленниками или мелкими торговцами — в Грузии XIX века фамилии по месту жительства не были признаком знатности. Аристократические грузинские фамилии обычно заканчивались на -дзе или -швили и имели другую историю. Перналиева — фамилия народная, бытовая, и её ценность именно в прямой привязке к конкретному селу, которое до сих пор стоит на карте.