Фамилия Пилкионис — один из ярких примеров литовского влияния на русский ономастикон, и её разбор стоит начать именно с географии и языковой принадлежности. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин или -ский, окончание -ис здесь указывает на литовское происхождение. Это типичный патронимический суффикс, который в литовском языке оформляет фамилии сыновей или потомков. Перед нами не просто фамилия, а её исходная, необрусевшая форма, что встречается реже, чем, скажем, фамилии на -ивичус или -онис.

Основа фамилии — Пилкион- — скорее всего, восходит к литовскому слову pilkas, что значит «серый». В таком случае Пилкионис — это потомок человека по прозвищу «Серый» (Pilkys, Pilkis). Прозвища по цвету волос или одежды были распространены повсеместно, и в литовской среде они давались так же часто, как и в славянской. Менее вероятная, но возможная версия связывает основу с глаголом pilti («сыпать», «лить»), что могло относиться к человеку, занятому насыпкой зерна или отливкой металла. Однако цветовая версия проще и логичнее, поскольку суффикс -ионис типичен именно для прозвищ, ставших фамилиями.

Словообразовательная модель фамилии Пилкионис прозрачна для литовского языка. Суффикс -onis (в родительном падеже -onio) образует отчества и фамилии, указывая на принадлежность: «сын такого-то». В русском языке такие фамилии часто склоняются как существительные мужского рода (Пилкиониса, Пилкионису), но могут оставаться и неизменяемыми в женском варианте. Стоит отметить, что в XIX веке, при русификации литовских фамилий, многие Пилкионисы могли сменить окончание на -ов, превратившись в Пилкионовых, но исходная форма сохранилась в семьях, которые не подверглись активной ассимиляции или жили в районах с компактным литовским населением.

Географически фамилия Пилкионис привязана к историческим землям Великого княжества Литовского — современной Литве, а также к западным областям Беларуси и некоторым районам Псковской и Смоленской областей России. В этих местах литовские фамилии на -ис, -ус, -ас не редкость. Социальный контекст: носители такой фамилии — это, скорее всего, крестьяне или мелкие шляхтичи, которые не перешли в православие и не сменили фамилию на русский лад. Фамилия не указывает на знатное происхождение, но говорит о сохранении языковой и культурной идентичности предков. Таким образом, для человека с фамилией Пилкионис можно с высокой долей уверенности утверждать, что его предки были литовцами или литвинами, а прозвище родоначальника было связано с серым цветом.