Фамилия Пиногорова — женская форма фамилии Пиногоров, и её происхождение напрямую связано с мужской основой. Сама фамилия Пиногоров на первый взгляд кажется составной, похожей на «Пиногор» или «Пинагор», но при ближайшем рассмотрении её корень оказывается не столь очевидным.

Скорее всего, в основе лежит прозвище Пиногор. Первая часть «пино-» может восходить к диалектному глаголу «пинать» (толкать, бить ногой) или к имени Пиня — уменьшительной форме от православных имён Пётр, Ипатий или Степан (через форму Степин). Вторая часть «-гор» — это не обязательно гора. В русских говорах слово «гор» (или «горя») означало «горе», «беда», а также «пьяница» (от «горевать»). Таким образом, Пиногор могло быть прозвищем человека, который «пинает горе» — то есть борется с несчастьями, или, напротив, «пьяницы», которого «пинают» за его пристрастие. Вторая версия менее вероятна, но не исключена.

Однако есть и более простое объяснение: фамилия могла возникнуть от топонима — названия деревни или урочища Пиногоры (например, в Пермском крае или на Урале). В этом случае Пиногоровы — это выходцы из места с таким названием, где «Пины» — возможно, искажённое финно-угорское слово, а «горы» — русское. Такая модель образования фамилий (по названию местности с суффиксом -ов) типична для северных и уральских областей.

Суффикс -ов в мужской форме (Пиногоров) указывает на принадлежность: «сын Пиногора» или «из рода Пиногоровых». Это одна из самых распространённых моделей русских фамилий. Фамилия редкая, встречается преимущественно в Вологодской, Кировской областях и на Урале. Сословного барьера у неё не было: её могли носить как крестьяне, так и мещане, поскольку прозвищное происхождение не выдаёт знатного предка.

Однокоренных фамилий, вроде Пинаев или Пиньков, много, но Пиногорова стоит особняком из-за неочевидной внутренней формы. Спор о том, что значит «пино-», остаётся открытым, но именно эта неоднозначность и делает фамилию интересной для этимолога.