Фамилия Пиртахия — редкая и нестандартная для русского уха. В ней нет привычных суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу наводит на мысль: перед нами не исконно русская фамилия крестьянского или дворянского происхождения, а скорее более поздняя, книжная или иноязычная по корню.

Самая правдоподобная версия — фамилия имеет искусственное, семинарское происхождение. В XVIII–XIX веках в духовных училищах и семинариях будущим священникам нередко меняли фамилии на звучные, греческие или латинские по форме. «Пиртахия» может быть переосмыслением греческого слова «πύρταχος» (pýrtachos) или его производных. В греческом языке «πύρ» (pyr) означает «огонь», а корень «ταχύς» (tachýs) — «быстрый, скорый». В сумме получается нечто вроде «быстроогненный» или «огнебыстрый» — эпитет, который могли дать человеку с живым, вспыльчивым нравом, либо же его придумали как «говорящую» фамилию для семинариста, отличавшегося пылкостью в вере.

Вторая, менее вероятная версия — фамилия восходит к какому-то местному прозвищу, записанному на слух. В некоторых говорах «пиртать» означало толкать, пихать, суетиться. Если допустить, что основа «пиртах» — это искажённое диалектное слово с прибавлением греческого окончания -ия (типичного для семинарских фамилий), то фамилия могла означать «суетливый, непоседливый человек». Но эта гипотеза слабая, потому что в русских говорах такое слово не зафиксировано, а в качестве прозвища оно не встречается.

География фамилии Пиртахия крайне узкая. Носители встречаются в основном в южных регионах России и на Украине, что косвенно подтверждает семинарскую версию: южные епархии и Киевская духовная академия часто практиковали «учёные» фамилии с греческими окончаниями. В дореволюционных метрических книгах фамилия попадается у лиц духовного звания — псаломщиков, дьячков, священников.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна: она не вписывается ни в одну из стандартных русских моделей. Если бы её хотели «обрусить», она звучала бы как Пиртахов или Пиртахин, но не Пиртахия. Сохранение греческого окончания -ия — главная улика, указывающая на книжное, а не бытовое происхождение. Искать в ней славянские корни или связь с профессией предков бесперспективно: это фамилия, которую «сочинили», а не унаследовали от прозвища.