Фамилия Питоня, очевидно, представляет собой застывшую форму аналогичного имени. В свою очередь имя Питоня может являться производной формой одного из крестильных имён: Капитон (в переводе с латинского означает «большеголовый») или Питирим (происхождение имени неизвестно).