Фамилия Плоохотниченко — редкий случай, когда написание говорит о происхождении больше, чем привычное звучание. Двойное «о» в корне не орфографическая ошибка, а след отчётливого произношения: в украинских говорах и в южнорусских диалектах первое «о» тянули, выделяли голосом, и это закрепилось на письме. Основа та же, что у фамилии Плохотниченко, — прозвище Плохотник.

Плохотник — человек, которого считали нерадивым, плохим работником или попросту неудачником. Суффикс -ник указывает на лицо по характерному признаку: так же образованы слова «бездельник», «ленивец». Но в крестьянской среде прозвище могло закрепиться иронически — за тем, кто вечно жаловался на жизнь или всё делал невпопад. Прямой связи с ремеслом тут нет, в отличие от фамилий вроде Плотниченко.

Суффикс -енко — типичный украинский патронимический формант, означающий «сын», «потомок». Плоохотниченко — буквально «сын Плохотника». Такая модель была особенно распространена в Левобережной Украине, на Полтавщине, Черниговщине, в Слобожанщине. География фамилии это подтверждает: большинство носителей и сегодня живут в Харьковской, Сумской и Белгородской областях.

Ударение в фамилии плавающее: в русском языке чаще ставят на предпоследний слог — Плоохотниче́нко, в украинском — на третий от конца, Плоохо́тниченко. Это нормально для фамилий с двойным корнем и длинным суффиксом.

С точки зрения словообразования интересно, что исходное прилагательное «плохой» в украинском дало не только Плохотника, но и целое гнездо фамилий: Плохутенко, Плохотнюк, Плохий. Но Плоохотниченко стоит особняком из-за графического удвоения — оно превратило обычную фамилию в маркер диалектного произношения. Если встретите такое написание в документах XIX века, скорее всего, перед вами запись со слов самого крестьянина, а не канцелярская переделка.