Фамилия Плтокина — редкий случай, где написание вводит в заблуждение. С высокой вероятностью, перед нами не самостоятельная фамилия, а искажённая запись фамилии Плотокина или Плоткина. В русской ономастике сочетание «плт» без гласной между согласными нетипично для исконных слов, и, скорее всего, это результат описки в паспортном столе или ошибки переписчика. Если же фамилия именно Плтокина, то её основа — «Плток» — могла быть прозвищем, но объяснить его без привлечения диалектов почти невозможно.

Самая правдоподобная версия — фамилия образована от слова «плоток» (уменьшительное от «плот»). В таком случае основа восходит к прозвищу человека, который строил плоты или сплавлял лес. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Плтокин — сын Плотока. Женская форма Плтокина закрепилась за потомками по женской линии или как вариант записи.

Если же отбросить орфографическую случайность, то фамилия могла возникнуть в северных или волжских регионах, где речной сплав был основным промыслом. Плотогоны, или плотошники, составляли особую профессиональную группу, и их прозвища легко становились фамилиями. В этом случае Плтокин — потомок человека, чья работа была связана с водой и лесом.

Альтернатива — связь с диалектным «плотка» (птица, птаха) или «плоток» (мелкая рыбёшка). Такие прозвища давали невысоким или шустрым людям. Но эта версия слабее: прозвища от названий животных чаще образовывались через суффикс -к- (Плотка → Плоткин), а не через -ок-.

Итог: фамилия Плтокина почти наверняка является вариантом написания Плотокина. Её носители — потомки плотогонов или, реже, людей с прозвищем от мелкой живности. Точное происхождение можно установить только по архивным записям конкретной семьи — именно там видно, как фамилия меняла буквы при переписи.