Фамилия Подмосинда — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, образовано от имени собственного с помощью приставки «подо-» или «под-», указывающей на положение «ниже», «рядом», «под властью». В основе лежит, по всей видимости, мужское имя Мосинда, которое само по себе не является каноническим церковным именем, а представляет собой местную, диалектную или иноязычную форму.

Самый вероятный источник — финно-угорское происхождение. В карельском, вепсском или коми языках «мос» может означать «корова», а «инда» — суффикс или часть сложного слова, обозначающая «место», «земля» или «хозяйство». Таким образом, «Мосинда» могло быть прозвищем владельца коровьего пастбища или человека, жившего на земле, пригодной для выпаса скота. Приставка «под» в таком случае указывает на географическое положение: «живущий под Мосиндой» — то есть рядом с урочищем или деревней с таким названием.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая для северных регионов: «Мосинда» — это искажённое «Мосенда» или «Мосендя», производное от крестильного имени Моисей (в просторечии Мосей, Мось). Тогда Подмосинда — это «сын того, кто живёт под (двором) Моисея». Однако такая модель словообразования (приставка + личное имя в родительном падеже) встречается реже, чем топонимическая.

Географически фамилия почти наверняка привязана к Русскому Северу — Архангельской, Вологодской областям или Карелии. В этих краях финно-угорский субстрат в топонимике и фамилиях — обычное дело, а модель «Под + что-то» (Подберезье, Подгора, Подкамень) широко распространена для обозначения селений у подножия или рядом с объектом. Фамилия Подмосинда могла возникнуть как прозвище крестьянина, жившего в деревне, стоящей «под Мосиндой» — под холмом, лесом или болотом с таким названием.

Суффикс -а в конце фамилии — типичное окончание для прозвищ и фамилий, образованных от топонимов (сравните: Заостровье — Заостровский — Заостров; Подмосинда — Подмосиндин). Окончание на -а не указывает на женский род, а закрепляет мужскую форму прозвища, которое позже стало фамилией. Носители фамилии Подмосинда — потомки крестьян или посадских людей, живших в малонаселённой местности на севере России, где каждое урочище имело своё имя, часто непонятное пришлому человеку.