Фамилия Подокшин — редкая и с неочевидной на первый взгляд основой. Если отбросить суффикс -ин, указывающий на принадлежность (чей? — сын Подокши), получим корень подокш-. Что он мог означать?

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «подокша» — так в некоторых русских говорах называли человека, живущего подле Оки или на Оке. Речь не о Москве-реке, а о крупной реке Оке, впадающей в Волгу. Приставка «под-» в этом случае работала как указание на расположение: «под Окой», то есть вблизи, в пойме или на берегу. Со временем прозвище Подокша закрепилось за человеком, а его дети стали Подокшиными. Географически фамилия тяготеет к рязанским, калужским, нижегородским землям — именно там Ока течёт полноводно и густо населена.

Существует и другая, менее убедительная гипотеза: от карельского или финского имени Подокша (возможно, искажённое крестильное имя). Но для этой версии нет весомых исторических подтверждений, и звуковой строй фамилии скорее указывает на русскую топонимическую основу, чем на заимствование.

Суффикс -ин — типичный для русских фамилий, образованных от основ на -а, -я. По этой же модели построены Путятин, Широкшин, Головин. Подокшин — фамилия недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская: прозвища по месту жительства давали простым людям, а не знати.

В дореволюционных переписях фамилия встречается редко, в основном в южных уездах Московской губернии и в Рязанской губернии. Встречаемость её и сегодня невысока, что делает Подокшиных носителями локального, почти забытого слова — названия человека, который жил у большой реки.