Фамилия Подпружникова — женская форма фамилии Подпружников. Её основа — «подпружник». В русском языке подпруга — это ремень, которым подтягивают седло к лошади (широкий ремень, охватывающий брюхо лошади). Соответственно, подпружник — это либо мастер, изготовляющий подпруги, либо конюх, который седлает лошадей и затягивает подпруги. Скорее всего, прозвище Подпружник дали человеку, чья работа была связана с лошадьми и конской сбруей: шорнику, конюху, кавалеристу или просто завзятому наезднику.

Суффикс -ов- в фамилии Подпружников указывает на типичную русскую модель образования от прозвищ и названий профессий (сравните: Кузнецов, Плотников, Коновалов). Форма на -ова — это притяжательное прилагательное, отвечавшее на вопрос «чей?»: сын или потомок Подпружника.

Интересная деталь: в отличие от более распространённых «конских» фамилий (Конев, Жеребцов, Уздечкин), Подпружников прямо указывает на конкретную деталь упряжи — подпругу. Это ремесленная, узкопрофессиональная фамилия. Встречается она редко, в основном в центральных и южных регионах России, где коневодство и кавалерия были развиты.

Вторая, менее вероятная, но возможная версия: в некоторых говорах «подпружником» могли называть не только ремень, но и часть ткацкого станка или другого механизма. Тогда фамилия могла достаться мастеровому, работавшему с такой деталью. Однако первое, «конное» значение — основное и самое правдоподобное.