Фамилия Подыганова — женская форма фамилии Подыганов, и её происхождение напрямую связано с прозвищем Подыган. В основе лежит слово «дыган», которое в русских говорах, особенно на юге и юго-востоке, означало цыгана. Приставка «по-» в прозвище указывала на действие или признак: «подыган» — это человек, который ведёт себя как цыган, то есть кочует, торгует, занимается барышничеством, или просто смуглый, чернявый. Таким образом, прозвище давали не по национальности, а по образу жизни или внешности.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов-/-ев- образовывал притяжательные прилагательные от мужских прозвищ или имён. Подыганов — буквально «сын Подыгана» или «из семьи Подыгана». Аналогичные фамилии — Подымаев (от «подымай»), Подопригора — строятся по той же модели с приставкой и глагольной основой.

Географически фамилия Подыганова редкая и сосредоточена в основном в центральных и южных регионах России, где были распространены цыганские таборы и где слово «дыган» входило в активный словарь. Встречается в Воронежской, Ростовской областях, а также на Кубани. В дореволюционных переписях носители фамилии чаще всего записаны как крестьяне или мещане, но точных данных о сословной принадлежности всех ветвей нет.

Стоит упомянуть, что существует версия о связи с тюркским «дыган» (ткач) или «туган» (родственник), но она менее убедительна: приставка «по-» в этом случае не даёт внятного смысла, а цыганская тема для прозвищ была типичной. Так что основная гипотеза — прозвищная, бытовая, без экзотики.

Фамилия сохранилась в единичных записях, и её носители сегодня — это, скорее всего, потомки тех самых «подыганов», которые когда-то выделялись среди односельчан своим беспокойным нравом или ремеслом.