Фамилия Подъюсова — редкий случай, когда географическая привязка просматривается почти наверняка, а вот с личным именем или прозвищем всё сложнее. В основе лежит топоним, а не имя: река Юг или её притоки. Приставка под- в русских фамилиях обычно указывает на жителя, чей дом или участок находился «под» каким‑то объектом — под горой, под лесом или, как здесь, под рекой. Человек, живший ниже по течению реки Юг или на берегу её притока, мог получить прозвище Подъюс — «тот, кто под Югом». Форма на -ов — стандартная модель притяжательного прилагательного: «чей?» — Подъюсов, то есть потомок Подъюса.

Река Юг — одна из крупных на севере Европейской России, сливаясь с Сухоной, образует Северную Двину. Поэтому основные очаги фамилии логично искать в Вологодской и Архангельской областях, а также в соседней Кировской, где есть свои «южные» гидронимы. В говорах этих мест слово «юс» могло означать не только реку, но и сырое, низинное место (от финно-угорского корня со значением «река», «вода»). Тогда прозвище Подъюс означало бы «живущий в сырой низине», что для северных болотистых краёв тоже правдоподобно.

Суффиксальная модель -ов типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на твёрдый согласный. Менее вероятна версия, что основа — имя Юс (древнерусское, хотя и редкое), а «под» — часть сложного прозвища, например, Подъюс как «тот, кто ниже Юса по статусу». Но в ономастике приставка под- в фамилиях почти всегда топонимична, поэтому версия с рекой или урочищем — основная.

Фамилия недворянская: крестьянская или посадская, что подтверждается её отсутствием в родословных книгах. Встречается она в основном в северных регионах, а также в Сибири — куда переселенцы с Севера уходили в XVII–XIX веках. Сегодня Подъюсовы живут рассеянно, но самые старые записи, скорее всего, относятся к Вологодчине. Однокоренные фамилии — Подъюков (от реки Юг или прозвища Юк) и просто Юсов — встречаются чаще, но Подъюсова выделяется именно редкой приставкой, которая сразу выдаёт географическое происхождение предка.