Фамилия Погубина — женская форма, а её мужской вариант Погубин. В центре внимания здесь не столько корень, сколько суффикс -ин, который указывает на принадлежность: Погубин буквально означает «сын Погубы» или «человек из рода Погубы». Основа фамилии — прозвище Погуба. В русских говорах слово «погуба» имело два основных значения. Первое, самое прямое — «погибель», «гибель», «разорение». Так могли прозвать человека, который приносил несчастья, был неудачливым или, наоборот, отличался крутым, «гибельным» нравом. Второе значение — диалектное, зафиксированное в северных и сибирских говорах: «погуба» означала «пропажа», «потеря», а также «беда» или «напасть». Прозвище могло быть дано в качестве оберега: родители называли ребёнка Погубой, чтобы отвести от него настоящие беды — своего рода «имя наоборот», когда плохое имя должно было защитить от злых сил.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с глаголом «погубить» в значении «испортить», «свести на нет». В таком случае прозвище мог получить мастер, который часто портил работу, или человек, склонный к пустым тратам и разорению хозяйства.

С точки зрения географии, фамилия Погубин встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. Это подтверждает связь с северными говорами, где слово «погуба» бытовало наиболее активно. Интересно, что фамилия не получила широкого распространения и остаётся относительно редкой — это говорит о том, что прозвище не было повсеместным и закрепилось в отдельных локальных родах.

Таким образом, предок современных Погубиных, скорее всего, получил прозвище по своему характеру или по стечению обстоятельств — либо как «бедовый» человек, либо как тот, кого считали причиной неудач. В любом случае, фамилия хранит в себе отголосок старинного народного мировоззрения, где имя и судьба были тесно связаны.