Фамилия Полиницин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Если отбросить интуитивное желание связать её с политикой или словом «полиция», то становится ясно: корень здесь другой. Суффикс -ин указывает на типичную русскую модель образования от прозвища или имени, оканчивающегося на -а/-я. Основа «Полиниц» — это, скорее всего, искажённое или диалектное произношение церковного имени Поликарп.

Вероятнее всего, Полиницин — это вариант фамилии Поликарпов, но прошедший через народную переделку. Имя Поликарп (от греческого «многоплодный») в просторечии часто сокращали до Полин, Полиня, Полица. От формы Полица с помощью суффикса принадлежности -ин и образовалась фамилия. Звук «ц» в основе мог возникнуть под влиянием южнорусского или белорусского «цоканья», где «ч» и «ц» смешиваются. Получается, что Полиницин буквально означает «сын Полины», то есть Поликарпа.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Полиница. В диалектах «полиница» могло означать что-то связанное с полем, поленицей (грудой) или, в редких случаях, с «поленицей удалой» — так в былинах называли богатыршу. Но эта версия слабее, так как не объясняет суффикс -ин в чистом виде.

Фамилия не относится к дворянским или купеческим — её носителями были, скорее всего, крестьяне или посадские люди, получившие фамилию по отцу-Поликарпу. Встречается она в основном в центральных и южных областях России, где фамилии на -ин особенно распространены. Написание с двумя «и» (Полиницин, а не Полиницын) — результат поздней фиксации в документах, когда букву «ы» после «ц» заменили на «и» по правилам орфографии.