Фамилия Полокайнен — редкий пример финского по происхождению родового имени, которое закрепилось в русском контексте. Основа фамилии — корень «полок-» (фин. polok-), который восходит к диалектному слову polokas или polokainen, означающему «небольшой, короткий, приземистый». В карельских и финских говорах так могли называть человека невысокого роста или плотного телосложения. Суффикс «-айнен» (фин. -ainen) — типичный для финской ономастики патронимический или описательный формант, аналогичный русскому «-ов»: он указывает на принадлежность к роду или на характерный признак. Таким образом, Полокайнен — это «сын (или потомок) Полокки» либо «тот, кого прозвали коротышкой».

Географически фамилия уходит корнями в регионы расселения карел и финнов-ингерманландцев: Карельский перешеек, Приладожье, юго-западное побережье Ладожского озера. В XIX веке, после присоединения Финляндии к Российской империи, часть носителей фамилии переселилась вглубь России, особенно в Олонецкую и Санкт-Петербургскую губернии. Встречаются варианты написания: Полокайнен, Полокайне, Полоканен — последний отражает ассимиляцию под русскую фонетику, где финальное «-ен» заменило финское «-айнен».

В русских документах фамилия фиксируется с середины XIX века, преимущественно в метрических книгах лютеранских приходов. Сословно носители относились к государственным крестьянам или мещанам, реже — к купечеству. Финский суффикс «-айнен» нередко воспринимался русскими писарями как окончание, поэтому в переписях встречаются искажения: Полокайнов, Полоканов. Такие формы — уже результат русификации, когда фамилию «подгоняли» под привычную модель с суффиксом «-ов».

Сравнение с однокоренными финскими фамилиями, например, Лайне, Рантанен, подтверждает, что Полокайнен — не единичный случай, а часть пласта финно-угорских родовых имен на северо-западе России. Интересно, что в самой Финляндии фамилия встречается редко, что указывает на её диалектное или локальное происхождение, возможно, из карельского языка, где слово polokku означает «клубок» или «комок» — метафора для коренастого человека.