Фамилия Полуполтинов — одна из тех, что хранят прямое указание на денежный счёт или имущественное положение предка. В её основе лежит слово «полуполтина»: так в старину называли монету или сумму в 25 копеек (половина от полтины, то есть от 50 копеек). Человек мог получить прозвище Полуполтинный или Полуполтинов, если он часто имел дело с этой монетой — например, торговал мелочью, менял деньги, работал сборщиком податей или просто был известен своей бережливостью до копейки.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: основа «полуполтин-» плюс типичный русский суффикс принадлежности «-ов». Это означает, что фамилию дали по отцу: сына Полуполтина (носителя прозвища) записали как Полуполтинов. Суффикс «-ов» указывает на великорусское происхождение, чаще всего из центральных или северных губерний, где такие патронимические фамилии были основным способом закрепить родовое имя.

Интересно, что в отличие от фамилий вроде Полтинников или Гривенников, которые тоже отталкиваются от номинала монет, Полуполтинов встречается реже. Это объясняется тем, что сама полуполтина как ходовая единица была менее распространена, чем полтина или гривна. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные «денежные» фамилии отмечены как характерные для купеческой и посадской среды, где люди постоянно имели дело с расчётами. Однако прозвище могло закрепиться и за крестьянином, который, например, единственный в деревне мог разменять крупную монету.

Поскольку фамилия недвусмысленная, споров о её происхождении почти нет. Встречается вариант написания с двумя «н» — Полуполтиннов — но это скорее описка или позднее искажение, так как исходное слово «полуполтина» пишется с одной «н». В архивных записях XVIII–XIX веков Полуполтиновых можно встретить в купеческих книгах и ревизских сказках городов центральной России, но массового распространения фамилия не получила: она осталась редкой, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска — найти своих предков по такой фамилии проще, чем по Ивановым или Кузнецовым.