Фамилия Помикайло — яркий пример того, как украинская словообразовательная модель закрепилась в русском фамильном фонде. В основе лежит глагол «помикати», который в юго-западных говорах означал «потрепать», «помять», «побить» или «помучить». Суффикс -айло (в украинском произношении часто редуцируется до -ало) образует названия лиц по характерному действию, причём с оттенком интенсивности или пренебрежения. Таким образом, Помикайло — это прозвище человека, который «помикал»: либо драчуна и задиры, либо, что вероятнее, того, кто постоянно «трепал» языком — надоедливого болтуна или ворчуна.

Словообразовательная модель с суффиксом -айло типична именно для украинской ономастики. Она породила целый ряд фамилий-прозвищ: Гуляйло, Ламайло, Бийло, Дергайло. В отличие от русских фамилий на -ов и -ин, такие формы не прошли стадию притяжательного прилагательного, а сразу закрепились в именительном падеже как готовое прозвание. Это указывает на то, что фамилия сложилась на украинской этнической территории — скорее всего, в черниговском, полтавском или харьковском регионе.

Спорных версий происхождения у этой фамилии немного. Иногда её пытаются связать с польским глаголом pomikać (мигать, мерцать), но это натяжка: семантика «мигания» не даёт убедительного прозвища для человека. Украинская основа «помикати» объясняет фамилию гораздо проще и естественнее. Редкая фамилия Помикайло интересна тем, что сохранила исходную форму прозвища без «обрусения» окончания — таких фамилий в официальных списках немного, и они ценны для историков языка как маркеры миграционных потоков из Малороссии в центральные губернии.