Фамилия Пониманский — одна из тех, что образованы по польской или западнорусской модели с суффиксом -ский, но с основой, которая звучит как русское слово. На первый взгляд кажется, что всё просто: от глагола «понимать». Однако в фамилиях редко закрепляются абстрактные действия, поэтому здесь стоит искать более конкретный корень.

Самая вероятная версия — происхождение от прозвища или имени Пониман. В старых русских говорах и в польском языке «пониманье» могло означать не только способность уразуметь, но и сговор, сватовство, взятие в жёны. Отсюда — «пониман» как человек, который «понял» невесту, то есть жених, или, шире, тот, кто заключал брачный сговор. Фамилии на -ский часто давались по названию места или по роду занятий, но прозвищная основа здесь не редкость. Если Пониманский — потомок человека по прозвищу Пониман, то его предок мог быть сватом, устроителем браков или просто человеком, которого так прозвали за удачную женитьбу.

Суффикс -ский в этой фамилии указывает на шляхетское или, по крайней мере, не крестьянское происхождение. В Российской империи такие фамилии чаще всего носили дворяне, духовенство или мещане, выходцы из Речи Посполитой. Фамилия Пониманский могла возникнуть на территории современной Беларуси, Украины или восточной Польши — там, где польская модель фамилий смешивалась с восточнославянской лексикой.

Менее убедительная версия — от географического названия. Пунктов с именем Понимань, Пониманы или Пониманск в доступных источниках не зафиксировано, но это не исключает существования хутора или урочища с таким именем, откуда мог выехать первый носитель фамилии. Однако отсутствие топонимов на картах делает эту гипотезу слабой.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Пониматко, Понимаев, Пониманов — показывает, что основа «поним-» встречается редко и почти всегда связана с действием или прозвищем. В отличие от массовых фамилий вроде Иванов или Кузнецов, Пониманский — штучный экземпляр, и её носители, скорее всего, происходят из одного небольшого рода.