Фамилия Пономренко — украинская по модели образования, но с русской основой. Суффикс -енко в украинской ономастике означает «маленький», «сын» или «потомок» (как и русское -ович). То есть Пономренко — это буквально «сын Пономаря».

Основа фамилии — слово «пономарь». Пономарь (от греческого «paramonarios» — приставленный к жилью) — низший церковнослужитель, который помогал священнику в алтаре: зажигал свечи, подавал кадило, звонил в колокола. В народе пономарей нередко называли «пономарями» или, в просторечии, «пономаренками». Отсюда и пошла фамилия: прозвище Пономарь (или Пономаренко) закрепилось за человеком, который либо сам служил в церкви, либо был сыном такого служителя.

Интересная деталь: в украинских фамилиях на -енко часто встречается чередование или упрощение согласных. В фамилии Пономренко мы видим, что от основы «пономарь» остался корень «пономр-», без гласной «а». Это характерно для разговорной речи: слово «пономарь» в быту могли произносить как «пономрь», и от этой сокращённой формы и образовали фамилию. Вариант Пономаренко (с полной основой) тоже существует, но Пономренко — более редкая, «стяжённая» форма.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России — в зонах, где было сильно влияние украинской антропонимики. Сословно носители фамилии, скорее всего, были выходцами из крестьян или казаков, реже — из духовенства, так как сам пономарь не считался священником, а относился к церковнослужителям, часто из низших слоёв.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями: Пономарёв (русская модель на -ов) встречается гораздо чаще, Пономаренко — стандартная украинская форма, а Пономренко — её диалектный или фонетический вариант, который закрепился в документах.