Фамилия Пороткина образована от прозвища или нецерковного имени Пороток. В русских говорах слово «пороток» имело несколько значений: так называли вспоротый живот, но в переносном, бытовом смысле — не в меру худого, тощего человека («кожа да кости»). Вторая версия ведет к глаголу «пороть» — не только «резать», но и «сечь розгами». Прозвище Пороток могли дать шалуну или тому, кого часто наказывали. Третье, более мирное значение — «пороток» как вид рыбы (мелкий сиг, или ряпушка), что характерно для северных и сибирских говоров. Тогда фамилия могла закрепиться за рыбаком или торговцем рыбой.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пороткин — «сын Поротка» или «из семьи Поротка». Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ с окончанием на -о, -а. Женская форма Пороткина — это вариант, закрепившийся за женщиной в документах XIX–XX веков, когда фамилии стали фиксироваться по мужской линии, но в быту передавались и через жену или вдову.

Фамилия довольно редкая. Её географическое ядро — северные регионы России (Архангельская, Вологодская области) и, возможно, Урал, где слово «пороток» в значении рыбы было в ходу. В центральных и южных губерниях такое прозвище встречалось реже, что делает Пороткиных локальной фамилией с отчетливым диалектным следом. Ономастические справочники (например, работы Б. Унбегауна) не выделяют Пороткиных в отдельную группу, но сама модель — от прозвища с корнем пор- — попадает в ряд таких фамилий, как Поротьев, Поротин, Поротов.

Если исходить из распространенности, то наиболее вероятная версия — прозвище по внешности или характеру, а не по рыбе. Однако для носителей фамилии из Архангельской области стоит учитывать и промысловую версию: предок мог быть не тощим, а умелым ловцом сига.