Фамилия Пракушкина — женская форма, мужской вариант — Пракушкин. Это редкая фамилия, и её разговорная, почти «домашняя» форма сразу подсказывает направление поиска: перед нами не дворянский или книжный вариант, а фамилия, возникшая в крестьянской или мещанской среде.

Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Пракушка. В русской ономастике суффикс -ушк- (как в словах «дедушка», «бабушка») часто использовался для образования ласкательных, обиходных форм личных имён. Пракушка — это, скорее всего, уменьшительное от имени Прокофий (в просторечии Прокоп, Прокуша) или от редкого имени Прокл. В некоторых говорах «прокуда» означало озорника, проказника, и если прозвище дали по характеру, то Пракушкой могли назвать непоседливого ребёнка.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — пракушкин сын, то есть сын Пракушки. Такая модель образования (от прозвища или имени на -а/-я через суффикс -ин) — одна из самых массовых в северных и центральных губерниях России. Фамилия фиксируется в документах Рязанской и Владимирской областей, что косвенно подтверждает её происхождение от просторечного Прокофий, популярного именно в этих краях.

Интересная деталь: фамилия Пракушкин сохранила архаичное ударение на второй слог (Пра-ку́-шкин), что нехарактерно для многих фамилий на -ин, где ударение часто смещается на суффикс. Это говорит о том, что фамилия не «переделывалась» под общий стандарт, а бытовала в устной речи именно так, как её произносили в деревне. Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Прокофьев, Прокопьев, Прокудин, — то Пракушкин стоит особняком: он не от полного церковного имени, а от его деревенского, уютного варианта.